Imagino que la principal razón es que un .ratdvd es de menor tamaño que un .iso.
Por lo demás, y a los fines prácticos, un ISO es más práctico para todo. RatDVD obliga a sus usuarios a tener Windows, ya que no existen descompresores RatDVD para Linux, por ejemplo.
Como siempre, se gana en algo pero se pierde en otro aspecto.